Discovery Studio 2021 v21.1完整版下载+安装激活教程

Discovery Studio 2021是一款面向生命科学领域的新一代分子建模和模拟环境。它服务于生命科学领域的实验生物学家、药物化学家、结构生物学家、计算生物学家和计算化学家，应用于蛋白质结构功能研究，以及药物发现。为科学家提供易用的蛋白质模拟、药物的设计与优化工具。通过高质量的图形界面、经多年验证的科学算法以及集成的环境，DS将实验数据的保存、管理与专业水准的建模、模拟工具集成在一起，为研究队伍的合作与信息共享提供平台。

Discovery Studio 2021是BIOVIA公司针对生命科学领域所开发，一个功能强大的研究平台，整合了广泛的资讯学、分子模型建造和模拟工具，应用于蛋白质体、标靶药物开发过程与研究，为科学家提供易用的蛋白质序列比对、优化、结构药物设计工具。

Discovery Studio 是专业的生命科学分子模拟软件，DS目前的主要功能包括：蛋白质的表征（包括蛋白-蛋白相互作用）、同源建模、分子力学计算和分子动力学模拟、基于结构药物设计工具（包括配体-蛋白质相互作用、全新药物设计和分子对接）、基于小分子的药物设计工具（包括定量构效关系、药效团、数据库筛选、ADMET）和组合库的设计与分析等。

DS BIOVIA Discovery Studio 2021功能特点

•  生物大分子：蛋白/核酸的序列分析、蛋白进化分析、蛋白质三维结构的预测与模拟、蛋白质结构表面电荷分析及pKa值预测、膜蛋白的结构预测与模拟、抗体结构的预测与模拟、蛋白理性设计、虚拟氨基酸突变、二硫键预测、虚拟丙氨酸扫描、虚拟饱和突变、蛋白聚集效应预测、抗体的设计与优化、抗体人源化、抗体亲和力成熟、酶的设计与优化、核酸的设计与模拟、蛋白-蛋白（核酸/多肽）相互作用预测、蛋白-小分子相互作用预测、X-ray晶体结构解析等；
• 计算化学：分子力学计算和分子动力学模拟、拉伸分子动力学模拟、量子力学/分子力学（QM/MM）计算等；
• 基于靶标结构药物设计：基于靶标结构的化合物虚拟筛选、全新药物设计、me too/me better药物设计、药靶作用机制解释、分子对接、基于片段的药物设计与改造等；
• 基于配体药物设计部分：完全基于配体的药效团设计、基于配体-受体复合物的药效团设计、化合物数据库的构建和筛选、药效团数据库的构建与保存、基于药效团数据库的反向找靶、定量构效关系分析（QSAR/QSPR）、构效关系分析（MMP）、虚拟组合化学库的设计与分析、类药性筛选、化合物构象搜索和分析、化合物ADMET性质预测等；

DS BIOVIA Discovery Studio 2021新增功能

多位点 Lambda 动力学工作流程。

• 单一协议 MSLD 偏置优化和生产，将三个协议整合在一起，简化了操作流程，并增强了 CHARMm 在 GPU 上的用户体验。
• 可在一次模拟中计算整个组合库的相对结合自由能，模拟竞争性结合测定。
• 大规模²验证证实了该方法的准确性，可用于在早期先导化合物优化阶段探索大型同系物化学空间。

新增使用 CHARMm-DOMDEC 进行自由能微扰计算。

全新的 CHARMm 相对自由能微扰计算协议支持在 GPU（Linux 系统）上对多个系统进行自由能微扰计算。

• 正向和反向自由能估算
• 自定义 lambda 调度，在末态附近设置更窄的窗口以提高精度。

客户端 4K 支持：适用于 Windows 的 Discovery Studio 客户端现在支持高分辨率显示器。

药效团

• 药效团特征：基于配体的药效团协议现在支持非键合药效团特征。这些特征可在这些协议的“特征”参数以及“编辑和聚类特征”工具面板中作为选项使用。
• 配体分析器：完整的 PharmaDB 数据库不再需要单独安装，默认情况下即可使用。PharmaDB 数据库已使用新的非键合药效团特征重新生成。

蛋白质建模

• 蛋白质对接 (ZDOCK)：您现在可以通过在 GPU 上运行来加速该协议（Linux 和 Windows）。
• RCSB 结构搜索：RCSB 宣布将于 2020 年 11 月停止使用旧版搜索 API。该协议已更新为使用新的 API。
• 计算蛋白质制剂特性：该协议现在计算按表面电荷图着色的分子表面和聚集分数，并在结果中显示。
• Blast 搜索 (NCBI 服务器)：该协议已更新，包含新的基于组成的统计选项和超时参数。服务器轮询和错误处理已得到改进。

受体-配体相互作用

• 杂化：Pipeline Pilot 对氮杂化的识别已更新。
• 配体对接 (GOLD)：该协议现在与 GOLD 2020 兼容。

模拟

• 使用显式膜溶剂化：您现在可以通过在 GPU 上运行来加速该协议（Linux 和 Windows）。
• 动力学 (NAMD)：您现在可以通过在 GPU 上运行来加速该协议（Linux 和 Windows）。
• 新的协议 MSLD Bias Optimization and Production 允许您在一个协议中运行 MSLD Bias 优化、生产和结果整理步骤。它还支持在同一协议中处理蛋白质-配体复合物和游离配体系统。您可以通过在 GPU 上运行来加速该协议（Linux）。
• 新的协议 CHARMm Relative FEP Calculations 允许您在 GPU 上运行 FEP 计算（Linux）并整理来自多个系统的结果。它还允许在同一协议中运行蛋白质-配体复合物和游离配体系统。
• 使用 MATCH 对配体进行类型化（原型）：该协议实现了一种新的分层原子类型分配器，可以更准确地分配原子类型。MATCH 使用的模板参数文件也已更新，包含新的原子类型。此外，优化的参数可以更准确地分配键和角参数。

DS BIOVIA Discovery Studio 2021 v21.0安装教程

请严格按照下面的教程安装。

1，解压BIOVIA_2021.DiscoveryStudio2021_Win64.7z

双击DiscoveryStudio2021\bin\scitegicsetup.exe，开始安装软件

选择软件的安装目录

注意：如果你想安装在其他盘的话，更改C盘为其他盘符即可，其余不要更改

在许可证界面，浏览选择msi.lic许可证

选择要安装的产品组件，一般默认即可

HTTP Port / HTTPs Port 端口保持默认

之后完成软件的安装。

2，解压BIOVIA_2021.BIOVIABiologyGPL2021_Win64.zip

双击BIOVIABiologyGPL2021_Win64\bin\scitegicsetup.exe 安装GPL

点击Add Products

程序会自动识别已有的许可证，不过这里我们以防万一，还是再次浏览选择一下msi.lic许可证

选择一下要安装的组件，默认即可

在web server界面会弹出警告提示，点击Stop Services停止服务

然后点击下一步，完成软件的安装

2，双击BIOVIA_2021.DS2021Client.exe，安装客户端

3，上面全部完成后，复制msi.lic许可证文件到如下路径中

C:\Program Files (x86)\Accelrys\LicensePack\Licenses\
C:\Program Files (x86)\Accelrys\LicensePack\share\data\
C:\Program Files (x86)\Accelrys\LicensePack\win32\bin\

4，运行桌面上的Discovery Studio 2021 Client

在软件的主界面右下角，点击Server:<none>会弹出的change Server，

Server name 填写  https://localhost:9943

点击OK后，会看到绿色链接成功

5，安装激活成功