SoftGenetics NextGENe 2.4.2.3破解版

2019-08-18 | 标签»分享

NextGENe是分析由ION PGM™，Roche Junior，Illumina MiSeq以及高通量系统（如Ion Torrent Proton，Roche FLX，Applied BioSystems SOLiD™和Illumina®平台）生成的桌面测序数据的完美分析合作伙伴。 NextGENe软件在Windows®操作系统上运行，提供生物学家友好的点击界面，不需要脚本或其他生物信息学支持，在使用CLC Bio，LaserGene，DNASTAR，MAQ，SOAP，Top等程序时通常需要支持帽子，BWA和Bowtie。

NextGENe软件在一个独立的多应用程序包中采用了独特的平台特定技术。 NextGENe软件包含用于SNP / INDEL和结构变异分析（重测序和扩增子分析），拷贝数变异（CNV），预测和罕见疾病发现的分析模块; 全基因组比对;转录; 外显子和转录物表达水平的交替剪接; RNA Seq; ChIP-Seq，基因表达系列分析（SAGE）分析; 数字基因表达（DGE），外显子组装和变体发现; miRNA分析和定量;宏基因组学; de novo assembly，CNV和Exome Capture。

NextGENe 2.4.2.3包含用于筛选拷贝数变异的新批量CNV工具，用于从大多数市售化学品中去除重复读数的独特分子标识工具，以及用于分析来自NEBNext Direct Cancer HotSpot面板和Direct BRCA面板的数据的模板。该软件还提供读入定相功能，用于与各种基因组构建共享参考轨道的工具，以及与轨道管理器集成的预加载参考。该软件与SoftGenetics的遗传学家助手NGS Workbench集成。
NextGENe的AutoRun工具允许用户快速设置作业文件，以指定用于分析多个项目的样本文件，参考文件和设置。 NextGENe AutoRun扫描作业文件以检查处理作业所需的所有文件的可用性。当文件可用时，NextGENe AutoRun启动NextGENe以开始处理作业。工作连续处理。如果某些文件不可用，NextGENe AutoRun将定期以NextGENe AutoRun设置中指定的时间间隔重新检查文件。可以轻松编辑作业文件以添加其他作业或编辑尚未处理的作业。
此外，当NextGENe当前正在处理另一组作业时，可以将其他作业添加到队列中。一旦第一个列表完成，NextGENe将自动开始排队的下一个作业列表。 NextGENe可用于分析来自Illumina GA，MiSeq和HiSeq系统，Roche / 454 GS FLX，FLX Titanium和Junior，Applied Biosystems的SOLiD系统，Ion PGM和PacBio平台的下一代测序数据。提供多种应用类型，包括SNP / Indel分析，RNA-Seq，从头组装和ChIP-Seq。结果显示在交互式NextGENe Viewer中，提供了其他商业程序中没有的详细可视化，如Lasergene的SeqMan Pro，CLC Bio和DNASTAR的NGEN，或者在TopHat，Bowtie和BWA等开源工具中。